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一种基于微生物标记的体液斑迹鉴别与沉积时间推断模型及其构建方法和应用
本发明提供了一种基于微生物标记的体液斑迹鉴别与沉积时间推断模型及其构建方法和应用,属于法医物证鉴定技术领域。本发明建立的检测与分析体系能够从单一或混合斑迹样本中实现对血液、精液、唾液三种常见体液的准确鉴别,并同步完成对其沉积时间的可靠推断。...
一种基于口腔微生物的中-非流动人群族源鉴定的法医模型及其构建方法
本发明提供了一种基于口腔微生物的中‑非流动人群族源鉴定的法医模型及其构建方法,属于医用模型构建技术领域。本发明提供的鉴定模型能够实现对长期居住于中国的群体、长期居住于非洲的群体以及从非洲迁徙至中国的流动人群进行准确区分。该模型可直接应用于犯...
一种基于跨模态多源迁移学习的噬菌体受体结合蛋白宿主预测方法
本发明公开了一种基于跨模态多源迁移学习的噬菌体受体结合蛋白宿主预测方法,该方法通过利用化学毒性数据增强宿主预测精度,克服了噬菌体序列数据稀缺的挑战。首先,利用共享的双向长短期记忆网络编码器处理来自化学和生物学两个模态的特征,捕获结构和序列信...
一种面向spot空间转录组的图卷积网络细胞通讯方法
本发明提供了一种面向spot空间转录组的图卷积网络细胞通讯方法,它解决了细胞间通讯强度计算等问题,其利用scRNA‑seq数据模拟生成ST数据,作为训练数据集,并通过反卷积获得细胞类型分布概率,根据细胞类型的空间位置确定距离参数,从而预测细...
空间蛋白组学预训练语言模型的构建与预测方法及设备
本公开涉及生物信息学技术领域,尤其是提供一种空间蛋白组学预训练语言模型的构建与预测方法及设备。上述方法包括:获取空间蛋白组学数据集,并通过预处理将空间蛋白组学数据集转换为蛋白表达序列;将蛋白表达序列输入训练后的空间蛋白组学模型,生成空间蛋白...
基于活性口袋构象特征的还原脱卤酶工程适应性筛选方法
本发明适用于生物信息学与酶工程技术领域,尤其涉及基于活性口袋构象特征的还原脱卤酶工程适应性筛选方法,所述方法包括:获取待筛选酶的氨基酸序列;基于氨基酸序列构建蛋白质三维结构模型,并对蛋白质三维结构模型进行构象松弛优化;识别并计算所述蛋白质三...
一种基于整合免疫与微生物组学的胃腺癌分型方法
本发明公开了一种整合免疫与微生物组学的胃腺癌分型方法,步骤为:S1.获取预处理肿瘤组织转录组及微生物组测序数据;S2.转录组数据估算免疫细胞浸润谱,无监督聚类得免疫亚型;S3.微生物组数据获属水平丰度谱,无监督聚类得微生物亚型;S4.组合两...
一种单细胞Hi-C图谱的伪时序推断方法及相关装置
本发明公开了一种单细胞Hi‑C图谱的伪时序推断方法及相关装置,包括:从原始测序文库中提取单细胞Hi‑C接触矩阵;对提取的单细胞Hi‑C接触矩阵进行插补与特征增强,生成增强后的接触矩阵;基于增强后的接触矩阵,提取单细胞多阶染色质结构特征,并将...
一种基于生成式神经网络的单细胞化学扰动转录响应预测方法及其应用
本发明公开了一种基于生成式神经网络的单细胞化学扰动转录响应预测方法及其应用,该预测模型的生成式神经网络构建可学习的条件映射函数,在预测模型训练时构建多模态嵌入,并采用零膨胀高斯负对数似然损失函数对训练成果进行优化;而多模态嵌入是条件映射函数...
一种基于XGBoost模型的亲缘关系等级的推断方法
本申请实施例提供一种基于XGBoost模型的亲缘关系等级的推断方法。该方法包括:获取第一个体的基因分型数据与第二个体的基因分型数据;根据第一个体的基因分型数据与第二个体的基因分型数据,确定第一个体与第二个体之间的亲缘特征;基于训练好的推断模...
一种家畜抗病性状的多态性遗传标记筛选方法及应用
本发明公开了一种家畜抗病性状的多态性遗传标记筛选方法及应用,涉及动物分子遗传学与基因组育种技术领域,本发明通过单细胞转录组测序定位抗病关键细胞亚群,再针对性开展该纯化亚群的eQTL分析,用于解决依赖混合样本导致标记缺乏细胞类型特异性的缺点,...
索引跳跃识别方法、识别模型训练方法及相关装置
本申请公开了一种索引跳跃识别方法、识别模型训练方法及相关装置。本申请提供的索引跳跃识别方法,先获取待识别的目标测序读段在A/T/G/C四通道上的亮度数据,包括来自插入片段读段的亮度数据和来自标签的索引亮度数据,基于这些亮度数据提取能够表征信...
一种基于甲基化矢量的肺癌亚型特异性甲基化区域识别方法、生物标志物及应用
本发明公开了一种基于甲基化矢量的肺癌亚型特异性甲基化区域识别方法、生物标志物及应用,涉及序列分析技术领域,方法包括,获取待分析样本的亚硫酸氢盐测序数据并预处理;在参考基因组上滑动窗口扫描,对覆盖窗口内全部CpG位点的读段按位点顺序编码为甲基...
基于等变图神经网络和预训练模型的蛋白质-核酸结合位点预测方法
基于等变图神经网络和预训练模型的蛋白质‑核酸结合位点预测方法,属于蛋白质功能性位点预测技术领域。首先,收集并整理了蛋白质‑DNA和蛋白质‑RNA复合物的数据集,以此构建训练集和测试集。然后,按照以下四个步骤进行:一是基于蛋白质三维结构信息,...
一种基于属级特异性识别的真核藻类爆发预警方法及系统
本发明涉及环境监测与水生态安全技术领域,尤其涉及一种基于属级特异性识别的真核藻类爆发预警方法及系统。所述方法包括以下步骤:在监测位置按照预设采样计划采集水体样本,并采集环境测量值,分别获得环境参数数据与水样采样标识及采样时间戳;基于水样采样...
一种基于Transformer模型的二维红外光谱蛋白质理化特性预测方法及系统
本发明提供一种基于Transformer模型的二维红外光谱蛋白质理化特性预测方法及系统,包括:首先构建包含海量静态蛋白质构象及其模拟2D IR光谱的源域数据集,训练Transformer模型学习通用的光谱特征与理化性质映射规则;随后,利用少...
基于遗传变异的因果推断方法、装置、电子设备及介质
本发明提供了一种基于遗传变异的因果推断方法、装置、电子设备及介质,包括:从检测平台获取目标人群的检测样本的全基因组SNP数据和蛋白质组数据;对全基因组SNP数据进行全基因组关联分析得到与目标表型相关联的结局SNP数据;基于全基因组SNP数据...
金属蛋白-配体结合构象及其结合亲和力的确定方法及装置
本发明公开了一种金属蛋白‑配体结合构象及其结合亲和力的确定方法及装置。本发明通过获取待对接配体对应的分子图及金属蛋白对应的金属蛋白图,将两者输入至分子对接模型。在分子对接模型中对金属蛋白图以及分子图进行处理,分别得到金属蛋白图的节点特征表示...
一种基于条件信息的蛋白质逆折叠方法
本发明公开了一种基于条件信息的蛋白质逆折叠方法,包括基于输入的蛋白质目标结构和条件信息,通过策略网络采样输出候选蛋白质序列以及对应的对数概率,然后通过所述对数概率确定当前候选蛋白质序列的采样概率。本申请构建了多目标奖励函数,用于对候选蛋白质...
蛋白质结构表征方法、装置、设备及介质
本申请公开了一种蛋白质结构表征方法、装置、设备及介质,涉及生物信息学领域,包括:将待处理蛋白质结构文件输入到目标表征生成模型;其中,目标表征生成模型包括目标孪生神经网络以及目标求解器;通过目标孪生神经网络基于待处理蛋白质结构文件生成包含各局...
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