杭州师范大学宋康丽获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州师范大学申请的专利多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121545583B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-08发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610063976.6,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统是由宋康丽;陈健翔;董衡;陈哲名设计研发完成,并于2026-01-19向国家知识产权局提交的专利申请。
本多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及数据分析技术领域,特别是涉及一种多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统。所述方法包括:将不同来源单细胞转录组数据的所有基因名称转换为统一版本,过滤来源特异性基因;构建特异性背景基因池并进行污染基因鉴定,消除背景RNA污染;计算每个样本细胞的平均测序深度,并对各个样本细胞进行测序深度校正;基于不同来源单细胞转录组数据,通过细胞分群及特征基因表达量分析进行细胞类型鉴定,得到各个细胞类型;针对每种细胞类型构建锚点细胞,对同一细胞类型的深度均衡细胞表达谱进行校正,得到整合后的细胞表达谱。提高了单细胞转录组数据整合分析的准确度,降低了多来源导致的批次效应对后续其他分析的影响。
本发明授权多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种多来源单细胞转录组数据的整合分析方法,其特征在于,所述方法包括: 统计不同来源单细胞转录组数据的所有基因名称,将各个所述基因名称转换为统一版本,将仅在单一来源中表达的基因记为来源特异性基因并进行过滤,得到基因集合的初始细胞表达谱; 构建特异性背景基因池,通过表达比例阈值和平均表达量阈值对所述初始细胞表达谱中各个样本细胞进行污染基因鉴定,并根据鉴定结果消除背景RNA污染,得到细胞净化后表达谱; 基于所述细胞净化后表达谱,计算每个样本细胞的平均测序深度,并对各个样本细胞进行测序深度校正,获得矫正深度后的深度均衡细胞表达谱; 基于不同来源单细胞转录组数据,通过细胞分群及特征基因表达量分析进行细胞类型鉴定,得到各个细胞类型; 针对每种细胞类型构建锚点细胞,包括:使用k-means算法将同一来源、同一细胞类型的细胞进行分类,并在分类后的细胞中随机抽取出种子细胞;确定与各个种子细胞对应的相似细胞,并将相似细胞的表达谱以平均值的方式合并,生成锚点细胞;基于所述锚点细胞计算所述深度均衡细胞表达谱质心及来源校正因子,对同一细胞类型的深度均衡细胞表达谱进行校正,得到整合后的细胞表达谱。
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