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龙图腾网获悉阳泉市三禾氧化锌有限责任公司;浙江工业大学申请的专利一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115565603B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-05发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211109815.4，技术领域涉及：G16B15/20；该发明授权一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法是由梁方;彭春祥设计研发完成，并于2022-09-13向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法在说明书摘要公布了：一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法，在进化算法框架下，首先，种群初始化，分两阶段对构象进行变异，交叉；其次利用SAXS实验数据计算模型相似性差用以辅助DEMO能量函数对解进行选择，同时通过蒙特卡洛概率接收准则保持选择过程中构象的多样性。最后通过模拟优化产生的可能包含多个态的模型。本发明提供一种采样效率高、预测组装精度高的SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法。

本发明授权一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法在权利要求书中公布了：1.一种SAXS数据辅助的两阶段多域蛋白质组装方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤： 1给定目标多域蛋白的全长序列和小角X散射实验数据SAXS，其中包括小角度X散射实验测定得到的蛋白质的散射向量qexp、谱强度Iexpq和实验误差eexpq； 2利用DomBpred结构域分割服务器对目标蛋白序列进行域分割，然后根据域序列利用AlphaFold2对域结构进行结构建模，得到多域蛋白的单域结构模型，并把单域结构模型N端和C端按照序列上的先后顺序链接到一起； 3设置参数：第一阶段种群大小NP1，第二阶段种群大小NP2，第一阶段交叉因子CR1，第二阶段交叉因子CR2，第一阶段温度因子β1，第二阶段温度因子β2，当前的代数g，置迭代代数g＝0； 4种群初始化：每一个域模型的移动用一个旋转向量和一个平移向量来表示，域组装的解形式表示为x1,y1,z1,θ1,φ1,ω1,…,xn,yn,zn,θn,φn,ωn，其中xn,yn,zn表示第n个域的平移向量，θn,φn,ωn表示第n个域的旋转向量； 5在解空间S1内随机生成NP1个初始解Ci，i＝{1,2，…,NP1}； 6对种群中的解Ci进行如下操作： 6.1将Ci设为目标解Ctarget，并从种群NP1中随机选出三个互不相同的解Ca、Cb和Cc，分别从Cb、Cc中随机选择一个不同域的旋转平移矩阵，分别替换Ca对应位置生成变异解Cmutant； 6.2生成随机数pCR，其中pCR∈0,1，若pCR＜CR1，则从Ctarget中随机选择一个域的平移和旋转向量，替换到Cmutant对应的位置生成测试解Ctrial′， 否则直接把Cmutant记为Ctrial′； 6.3若Ctrial′在解空间S1内，则把Ctrial′记为Ctrial，否则在解空间S1内随机生成一个解记为Ctrial； 6.4利用FoXS服务器分别计算出经Ctarget和Ctrial旋转平移后生成的全长模型的散射向量qtarget、qtrial，谱强度Itargetq、Itrialq，实验误差etargetq、etrialq； 6.5根据公式1计算经Ctarget和Ctrial旋转和平移产生的全长模型相似性差，其中M代表散射向量的数量，和分别代表第m个散射向量对应的SAXS实验的谱强度、FoXS服务器计算得到的经Ctarget变换后全长模型的谱强度和经Ctrial变换后全长模型的谱强度； 6.6若S≤0，则保留Ctarget； 6.7若S＞0，利用DEMO能量函数计算经Ctarget、Ctrial变换后生成的全长模型的能量EDEMOCtrial、EDEMOCtarget，如果EDEMOCtrialEDEMOCtarget， 则Ctrial替换Ctarget，否则按照概率以蒙特卡洛准则接收构象； 7g＝g+1，迭代运行步骤6，直至连续gtolerance代种群中最好的解不再发生改变，然后执行步骤8； 8设置差值解空间S2，并选择对种群NP1中前NP12的优秀个体形成新种群NP2，然后对种群NP2中的每个个体Ci进行如下操作： 8.1将种群NP2中的解Ci设为目标目标Ctarget，并从种群NP2中随机选出两个互不相同的解Ca和Cb，分别从Ca、Cb中随机选择同一个域的旋转平移向量，然后分别做差的到Ca、Cb再该域位置的旋转平移差值向量； 8.2若该向量再差值解空间S2中，则在Ctarget对应位置加上该差值向量，生成测试解Ctrial，否则在解空间中随机产生一个差值旋转平移向量加到Ctarget对应位置，成测试解Ctrial； 8.3利用FoXS服务器分别计算出经Ctarget和Ctrial旋转平移后生成的全长模型的散射向量qtarget、qtrial，谱强度Itargetq、Itrialq，实验误差etargetq、etrialq； 8.4根据公式1计算经Ctarget和Ctrial旋转和平移产生的全长模型相似性差，若 S≤0，则保留Ctarget； 8.5若S＞0，利用DEMO能量函数计算Ctarget、Ctrial的能量EDEMOCtrial、EDEMOCtarget，如果EDEMOCtrialEDEMOCtarget，则Ctrial替换Ctarget，否则按照概率以蒙特卡洛准则接收解； 9迭代运行步骤8，直至连续m代EDEMO最低的解不再发生改变，输出EDEMO最低的前n个解为最终结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人阳泉市三禾氧化锌有限责任公司;浙江工业大学，其通讯地址为：045011 山西省阳泉市郊区河底镇工业园区；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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