山西医科大学崔永萍获国家专利权
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龙图腾网获悉山西医科大学申请的专利一种基于蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌分子分型标志物及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117089616B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310981278.0,技术领域涉及:C12Q1/6886;该发明授权一种基于蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌分子分型标志物及其应用是由崔永萍;张玲;高迎真;成晓龙;杨斌;翟元芳;王芳;李泓漪设计研发完成,并于2023-08-07向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌分子分型标志物及其应用在说明书摘要公布了:本发明属生物医学技术领域,为解决目前ESCC的分子分型方法缺乏代谢组学的分型特征,缺基于蛋白质组学和代谢组学联合的食管鳞状细胞癌分子分型方法,提供一种基于DIA蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌ESCC分子分型标志物及其应用。标志物为4个蛋白和2个代谢物组成的组合,4个蛋白为:己糖激酶3即HK3,Sec1家族结构域蛋白1即SCFD1,胞裂蛋白5即SEPTIN5,信号序列受体α亚基即SSR1;2个代谢物为肌酸即Creatine,2‑脱氧‑D‑葡萄糖即2’DG。本发明填补了食管鳞癌研究领域基于蛋白质组学和代谢组学联合的分子分型方法的空缺,所提出的分子分型模型可作为一种食管鳞癌患者的诊疗和预后评价方法。
本发明授权一种基于蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌分子分型标志物及其应用在权利要求书中公布了:1.基于DIA蛋白质组学和非靶向代谢组学联合的食管鳞癌分子分型标志物在制备诊断食管鳞癌试剂中的用途,其特征在于:所述标志物为4个蛋白和2个代谢物组成的组合,其中4个蛋白为:己糖激酶3Hexokinase3,HK3,Sec1家族结构域蛋白1Sec1familydomain-containingprotein1,SCFD1,胞裂蛋白5septin5,SEPTIN5,信号序列受体α亚基Signalsequencereceptorsubunit1,SSR1;2个代谢物为肌酸Creatine,2-脱氧-D-葡萄糖2-Deoxy-D-glucose,2’DG, 所述标志物进行食管鳞癌Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC分型的具体方法为: 1收集用于组学检测的肿瘤组织以及配对的癌旁正常组织,同时收集对应的临床信息数据,组成实际分析队列; 2对实际分析队列进行DIA定量蛋白质组学以及非靶向代谢组学检测;对所得的数据进行质控分析,剔除异常样本,重新整合剩余样本的检测数据;对所得的数据进行标准化处理,并且筛选出肿瘤组织与癌旁组织显著差异的蛋白和代谢物,用于后续分型; 3根据步骤2所得差异表达蛋白和代谢物在肿瘤组织中的表达水平,利用相似性网络融合的方法将ESCC患者分为ESCCⅠ型、ESCCⅡ型与ESCCⅢ型; 4筛选步骤3中各亚型的特征蛋白和代谢物,并且构建出分类器模型,该分类器模型可区分Ⅰ、Ⅱ型与Ⅲ型; 所述分类器模型为4个蛋白和2个代谢物组成的组合,其中4个蛋白为:HK3,SCFD1,SEPTIN5,SSR1;2个代谢物为Creatine,2’DG;所述分类器模型评分的计算公式为:score=-1.384+0.449×expSCFD1+0.981×expCreatine+0.362×expSEPTIN5-0.608×expHK3-0.111×expSSR1-0.373×exp2’DG;当score值≤0时样本为ESCCⅠ、Ⅱ型,当score值>0时样本为ESCCⅢ型; ESCCⅠ型的患者总生存期和无病生存期最长、预后最好,而ESCCⅢ型的患者总生存期和无病生存期最短、预后最差。
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