Document
拖动滑块完成拼图
个人中心

预订订单
商城订单
发布专利 发布成果 人才入驻 发布商标 发布需求

请提出您的宝贵建议,有机会获取IP积分或其他奖励

投诉建议

在线咨询

联系我们

龙图腾公众号
专利交易 商标交易 积分商城 国际服务 IP管家助手 科技果 科技人才 会员权益 需求市场 关于龙图腾 更多
 /  免费注册
到顶部 到底部
清空 搜索
当前位置 : 首页 > 专利喜报 > 苏州贝康医疗器械有限公司侯美灵获国家专利权

苏州贝康医疗器械有限公司侯美灵获国家专利权

买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!

龙图腾网获悉苏州贝康医疗器械有限公司申请的专利一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117059164B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311026283.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法及其应用是由侯美灵;张军;朱秋洁设计研发完成,并于2023-08-15向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法及其应用。所述方法包括:筛选SNP位点,模拟数据,构建模型,根据模型进行污染度评估;所述筛选SNP位点包括以下步骤:1从数据库下载测序相关的FASTQ文件或bam文件;2对文件中每个样本的高通量测序数据进行变异检测,得到样本的变异信息gvcf格式文件;3合并所有样本gvcf文件,得到所有样本的vcf格式变异信息;4根据杂合状态人群频率和变异等位基因频率筛选SNP位点。本发明通过筛选稳定且携带人群频率高的SNP位点模拟数据,构建模型,根据模型进行污染度评估。这些SNP位点在不同样本中的AF值相对稳定,并集中分布在0,0.5和1附近,污染其它样本后其AF值的剂量变化可以准确反映样本交叉污染的程度,操作简单,快速方便。

本发明授权一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种基于SNP位点检测样本交叉污染的方法,其特征在于,所述方法包括: 筛选SNP位点,模拟数据,构建模型,根据模型进行污染度评估; 所述筛选SNP位点包括以下步骤: 1从数据库下载测序相关的FASTQ文件或bam文件; 2对文件中每个样本的高通量测序数据进行变异检测,得到样本的变异信息gvcf格式文件; 3合并所有样本gvcf文件,得到所有样本的vcf格式变异信息; 4根据杂合状态人群频率和变异等位基因频率筛选SNP位点; 其中,步骤4中所述筛选SNP位点包括:保留目标变异,删除INDEL位点,保留FILTER列为PASS且满足杂合状态人群频率和未分型比例的SNP位点,统计每个SNP位点在正常人群中杂合状态下AF值的标准差和纯合状态下AF值的标准差,进行加和,最后根据加和后的数值从小到大排序,选择AF值在0.4-0.6和0.9-1之间比例大于0.30的位点; 所述构建模型的方法包括一元线性回归或loess回归; 所述一元线性回归包括:计算每个SNP位点到0、0.5和1的AF值剂量变化,保留距离0最近的位点; 所述模型的公式为: 其中y为真实模拟的污染比例,x为一个污染的程度,根据AF×2计算得到,α为回归系数,β为截距,α和β根据模拟数据计算得到。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人苏州贝康医疗器械有限公司,其通讯地址为:215000 江苏省苏州市工业园区星湖街218号生物纳米园A3楼101单元;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。