圣湘生物科技股份有限公司杨丽获国家专利权
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龙图腾网获悉圣湘生物科技股份有限公司申请的专利核酸序列数据库构建方法、装置、设备及可读存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121350002B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511895649.9,技术领域涉及:G06F16/21;该发明授权核酸序列数据库构建方法、装置、设备及可读存储介质是由杨丽;石淞元;邓小龙;雷湘华;吴康;戴立忠设计研发完成,并于2025-12-16向国家知识产权局提交的专利申请。
本核酸序列数据库构建方法、装置、设备及可读存储介质在说明书摘要公布了:本申请涉及一种核酸序列数据库构建方法、装置、设备及可读存储介质。方法包括:获取目标病原体的多个标准基因组序列,其中,所述标准基因组序列表征所述目标病原体的靶向核酸特征;根据所有标准基因组序列的分类检索信息,对所述所有标准基因组序列去重,得到多个靶向核酸特征各不相同的非冗余基因组序列;生成包含每一所述非冗余基因组序列的分类检索信息的标准序列索引文件,以及包含所有所述非冗余基因组序列的靶向核酸特征的标准序列比对文件;根据所述标准序列索引文件和所述标准序列比对文件,构建所述目标病原体的核酸序列数据库。采用本方法能够使得构建的核酸序列数据库在保证数据覆盖范围的全面性的同时兼顾数据检索的效率。
本发明授权核酸序列数据库构建方法、装置、设备及可读存储介质在权利要求书中公布了:1.一种核酸序列数据库构建方法,其特征在于,所述方法包括: 获取目标病原体的多个标准基因组序列,其中,所述标准基因组序列表征所述目标病原体的靶向核酸特征; 根据所有标准基因组序列的分类检索信息,对所述所有标准基因组序列去重,得到多个靶向核酸特征各不相同的非冗余基因组序列; 生成包含每一所述非冗余基因组序列的分类检索信息的标准序列索引文件,以及包含所有所述非冗余基因组序列的靶向核酸特征的标准序列比对文件; 根据所述标准序列索引文件和所述标准序列比对文件,构建所述目标病原体的核酸序列数据库,其中,所述分类检索信息包括分类信息和索引信息;所述根据所有标准基因组序列的分类检索信息,对所述所有标准基因组序列去重,得到多个靶向核酸特征各不相同的非冗余基因组序列,包括: 根据所述分类信息,从所述所有标准基因组序列中筛选出所述目标病原体的每一分类群的候选非冗余基因组序列;根据所述索引信息,对所有代表基因组序列进行比对去重,得到所述多个靶向核酸特征各不相同的非冗余基因组序列,其中,所述根据所述分类信息,从所述所有标准基因组序列中筛选出所述目标病原体的每一分类群的候选非冗余基因组序列,包括: 根据所述分类信息,从所述所有标准基因组序列中筛选出所述目标病原体的每一分类群的代表基因组序列;根据所有代表基因组序列,构建所述目标病原体的标准序列索引表;对每一代表基因组序列进行序列分割,得到适配于靶向测序读长且覆盖每一所述代表基因组序列的靶向核酸特征的多个待比对基因组序列片段;根据每一待比对基因组序列片段和所述标准序列索引表之间的对应关系,从所有待比对基因组序列片段剔除跨分类群的冗余基因组序列片段,得到所述目标病原体的每一分类群的代表基因组序列片段;将所有代表基因组序列片段整合为所述候选非冗余基因组序列。
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